UFR Sciences et Techniques - Master Bio-Informatique, Bioinformatique Modélisation et Statistique

Le master mention Bioinformatique s'inscrit dans un contexte

de mutation de l'expérimentation en sciences du vivant vers le haut débit. Les productions massives de données en biologie génèrent un accroissement sans précédent des besoins en bioinformatique et biomathématiques en France comme au niveau international. Les défis du Big Data sont présents dans tous les domaines de la biologie : Médecine génomique & enjeux des diagnostics moléculaires et de la médecine personnalisée (maladies génétiques, immunopathologies, cancers, neuropathologies, maladies infectieuses, pathologies nutritionnelles et cardiovasculaires…); Génomique animale, végétale et bactérienne & enjeux des biotechnologies alimentaires (amélioration variétale et des bioprocédés industriels); Génomique environnementale & enjeux de la biodiversité (préservation des écosystèmes, ressources marines et terrestres, remédiation aux pollutions, bioénergies alternatives).

• Le master a pour objectif de former des ingénieurs bioinformaticiens et biostatisticiens spécialistes de la gestion, du traitement et de l’analyse des séquençages et données massives en biologie, issues de ces nouvelles approches expérimentales à très grande échelle (sciences -omiques).
• En trois années : L’expertise pluridisciplinaire de nos diplômés, à l’interface des sciences du vivant, de l'informatique et des mathématiques, s‘acquiert grâce à un programme original, ambitieux et progressif en 3 ans : Le master 2 se réalise en deux ans en alternance rémunéré sous contrat de travail (apprentissage ou professionnalisation).

Polyvalence : Les diplômés sont formés à choisir, implanter et utiliser, concevoir et développer des (nouveaux) outils, des méthodes, des modèles informatiques, statistiques et mathématiques destinés aux traitements des données massives en biologie issues des approches expérimentales à large échelle.

►Biologie et expérimentations à large échelle : connaissances approfondies des technologies en sciences omiques et biologie structurale à l’origine des grands jeux de données, enjeux fondamentaux et appliqués.
► Informatique : maîtrise de l’algorithmique, de langages de programmation, des systèmes de gestion de bases de données et technologies web; conception et développement de nouveaux logiciels; utilisation et déploiement des logiciels et chaînes de traitement sur des infrastructures informatiques distribuées pour le stockage et le calcul intensif (data center, cloud). Management de la qualité (bonnes pratiques de programmation, respect des normes de développement, risques et contraintes, traçabilité des traitements).
► Mathématique/Statistique : maîtrise des outils et modèles statistiques pour l’analyse des séquences, l’analyse des données et l’apprentissage statistique, la modélisation des systèmes dynamiques et réseaux, la programmation en statistiques.
► Bioinformatique : connaissance et maîtrise des principaux programmes et ressources internationales publiques du domaine, pour le développement de chaînes de traitement automatique des données, l’annotation des génomes et des données. Connaissance des méthodes et outils pour le traitement de données de séquençage, l’analyse protéomique, la construction de réseaux métaboliques et d’intéraction moléculaires. Algorithmique et outils bioinformatiques en génomique comparative, méthodes et outils en bioinformatique structurale.
► Développements personnels et professionnels : aisance en communication scientifique écrite et orale (prise de paroles et rédactions régulières, participation à des congrès), travail en langue anglaise écrite et orale, travail en mode projet. Développements personnels: esprit analytique, critique et de synthèse, esprit d’initiative et de réactivité, rigueur, ouverture d'esprit, créativité, autonomie et sens de l'organisation, goût du travail en équipe ( nombreux projets collaboratifs entre étudiants, pédagogie d’apprentissage par projet) , faculté à intéragir, conseiller et à transmettre ses connaissances dans un environnement pluridisciplinaire.

► En Master 1, le stage de 4 à 5 mois obligatoire peut être effectué à l’international (financement ERASMUS ou autre hors convention). Les bourses de mobilité et la procédure de candidature peuvent être consultés sur le site web de l’université,
onglet « international ».

► Au cours des deux années du M2, les étudiants ont l'opportunité de participer, individuellement ou collectivement, selon l'actualité scientifique, à différents évènements scientifiques : conférences de recherche nationales et internationales, séquences courtes de formation individuelle complémentaire à l'étranger.

Laboratoires de l'UFR Sciences et Techniques

- EA 4108 LITIS - Laboratoire d'Informatique, du Traitement de l'Information et des Systèmes

- UMR 6085 CNRS LMRS - Laboratoire de Mathématiques Raphaël Salem

- EA 4358 GLYCOMEV - Glycobiologie et Matrice Extracellulaire Végétale

- UMR 6014 CNRS COBRA - Chimie Organique et Bioorganique : Réactivité et Analyse

- UMR 1239 INSERM DC2N - Différenciation et Communication Neuronale et Neuroendocrine

- EA 4312 LMSM - Laboratoire de Microbiologie Signaux et Microenvironnement

- UMR 6143 CNRS M2C – Morphodynamique continentale et cotière – microbio. environnementale

- UMR 6270 CNRS PBS - Polymères, Biopolymères, Surfaces

Laboratoires de l'UFR Médecine-Pharmacie

- UMR 918 INSERM Génétique et clinique des proliférations lymphoïdes, en fusion avec

- UMR 1079 INSERM Génétique du cancer et des maladies neuropsychiatriques

- UMR 1073 INSERM Nutrition, inflammation et dysfonction de l'axe intestin-cerveau

- UMR 905 INSERM Physiopathologie et Biothérapies des maladies inflammatoires et autoimmunes

Plus largement en France le master bénéficie d'un solide réseau de plus de 120 partenaires en recherche académique et privée, pour l'accueil en stage de master 1 et en mission professionnelle de master 2 : près de 20 universités, 60 laboratoires d’organismes de recherche (CNRS, INSERM, INRA, IFREMER, INRIA, CEA, INSA, ENS, ANSES), de structures privées comme les Instituts
Pasteur et Institut Curie et d’autres Centres de Lutte Contre le Cancer ou fondations (Becquerel, Baclesse, Synergie Lyon Cancer), structures hospitalo-universitaires, plus de 25 entreprises (localement Interactive BioSoftware, et OmicX)

Master Bio-Informatique, Bioinformatique Modélisation et Statistique

Description et Objectifs

Compétences visées

International

Laboratoires partenaires

Conditions d'accès

Inscription

Tarif d'inscription

Validation d'Acquis d'Expérience (VAE)

Contenu de la formation

Master Bio-Informatique, Bioinformatique Modélisation et Statistique 1ère année

Master Bio-Informatique, Bioinformatique Modélisation et Statistique 2ème année

Informations sur le programme

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