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Assemblages Moléculaires, Modélisation et Imagerie par SIMS

AMMIS
Équipe du Laboratoire MERCI (EA 3829 - UFR Médecine-Pharmacie) et du Groupe de Physique des Matériaux (UMR 6634 - UFR Sciences et Techniques)
Responsable : Armelle Cabin-Flaman
Bâtiment Monod  -  Boulevard de Broglie
76821  Mont-Saint-Aignan cedex
Tél : 02 35 52 29 7802 35 52 29 78

L’équipe de recherche AMMIS est une équipe du laboratoire MERCI (EA 3829) et de l’UMR 6634 Groupe de Physique des Matériaux de l’Université de Rouen. Notre équipe s’est spécialisée dans l'application de l'imagerie SIMS à l'étude d'échantillons biologiques et plus particulièrement aux grands assemblages moléculaires à l'origine de nombreuses régulations cellulaires. Nous avons ainsi utilisé l'imagerie SIMS afin d'étudier à l'échelle moléculaire des fibres d'ADN peignées (Cabin-Flaman et al. 2011), des facteurs de transcription et des enzymes de réparation de l'ADN (Delaune et al. 2013). Le point commun de ces études est l'analyse quantitative et statistique, de signaux SIMS de faible à très faible intensité. Nous avons ainsi développé un logiciel d’analyse des signaux (Delaune et al. 2015).

Thèmes de recherche

 1) Rôle des assemblages de macromolécules (hyperstructures et des structures dépendant de leur fonction)
dans le phénotype de la cellule individuelle normale et pathologique, dans le cycle cellulaire :

  • Modélisation des assemblages dynamiques de macromolécules
  • Imagerie NanoSIMS 50 :
    - Imagerie de macromolécules (marquées ou non par des isotopes stables) et de leurs assemblages
    mise au point méthodologique
    - Imagerie cellulaire (cellules bactériennes, animales et végétales) : développement cellulaire, vieillissement
  • Conception et fabrication de nouvelles biopuces pour l'étude du protéome et du transcriptome de la cellule individuelle

2) Application de produits cosmétiques sur la peau humaine : élaboration de nouveaux procédés

Applications proposées aux tiers
Prestations d'analyse et d'imagerie NanoSIMS : analyses de surfaces et d'échantillons biologiques.


 
Collaborations
Universitaires
  • Genopole® Evry-Val-d'Essonne
  • Interdisciplinary Research Institute USR 3078 CNRS-Lille                      
  • Centre de Recherche Public-Gabriel Lippmann-Belvaux, Luxembourg
  • UMR 6270 PBS Université de Rouen
  • U 982 DC2N Université de Rouen 
Industrielles
  • Orsay-Physics, Aix en Provence
  • Cosmetic Valley, France
  • BioSIMS Rouen
Effectifs
  • 2 maîtres de conférences
  • 1 ingénieur



Techniques et équipements spécifiques
  • NanoSIMS 50
  • Leica CFD, Leica AFS
  • Ultramicrotomie et cryo-ultramicrotomie
  • Microscope à épifluorescence

Brevets
Un brevet intitulé « Method for biomolecule detection and quantification at the cell single level using secondary ion mass spectrometry » a été déposé aux USA (US 61/035,803 en date du 12 mars 2008). Un brevet intitulé « Improved method for a highly sensitive detection and quantification of biomolecules using secondary ion mass spectrometry (SIMS) and related technologies » a été déposé en Europe (EP09305855.0) en 2009.



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Offres de stages
Le laboratoire accueille des stagiaires de licences, de masters et des doctorants.